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Es una de dependencia de la Universidad Nacional de San Marcos. Fue fundado en 1918 y cuenta con exhibiciones de flora, fauna y minerales de las diferentes regiones del Perú. Muchas de las muestras que se exponen pertenecieron a la colección del italiano Antonio Raimondi, quien fue uno de los grandes amantes del Perú y un apasionado investigador de los recursos naturales de estas tierras. El museo recibe visitas de grupos de estudiantes, aunque tambien está abierto al público en general.
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